Filogenia y modelado de nicho ecológico del Delfín del Río Amazonas o Boto Inia geoffrensi

Abstract

Pese a que los delfines rosados son mamíferos acuáticos, variables ambientales atmosféricas asociadas a las cuencas de los ríos que habitan, así como la precipitación y la temperatura, son determinantes en su ecología, porque afectan directamente su ocurrencia en un área determinada. Se reconocen tres especies I. g. geoffrensis, I. g. boliviensis. En este trabajo, a través de herramientas de modelamiento de nicho, se pretende llenar vacíos de información en cuanto al potencial del nicho de la especie. En relacion con su filogenia, se espera reforzar los estudios que sugieren la separación de las especies Inia geoffrensis e Inia boliviensis. Las fuentes de datos ambientales (capas bioclimáticas actuales y a futuro 2050) se obtuvieron de WorldClim, las de las muestras de The IUCN Red List of Threatened Species y Global Biodiversity Information Facility (GBIF). La resolución espacial de todas las variables ambientales fue de 30 segundos de arco, mediante el programa Maxent. Los datos de nucleótidos de la información de los genomas mitocondrial Citocromo oxidasa I (COI) y Citocromo b (cytb) de los organismos en estudio con su respectiva secuencia, fueron extraídos en formato FASTA de la página de Internet National Center for Biotechnology Information (NCBI). Las secuencias de nucleótidos fueron alineadas por medio del programa digital Mesquite versión 3.2 y se les aplicó la prueba de parsimonia y la de máxima similitud, después de esto se le aplicó el Bootstrap y el Jacknife a los datos de Mesquite. Los resultados más destacados fueron que va a aumentar la probabilidad de nicho de las especies, y las especies más emparentadas según el COI son I. boliviensis e I.araguaeinensis y, según el cytb, son I.boliviensis e I. geoffrensi.

Abstract: Although pink dolphins are aquatic mammals, atmospheric environmental variables associated with the river basins they inhabit, as well as precipitation and temperature, are determining factors in their ecology, because they directly affect their occurrencein a given area. Three species are recognized I. g. geoffrensis, I. g. boliviensis. In this work, through niche modeling tools, it is intended to fill gaps in information regarding the potential of the niche of the species. In relation to its phylogeny, it is expected to reinforce the studies that suggest the separation of the species Inia geoffrensis and Inia boliviensis. Sources of environmental data (current and future 2050 bioclimatic layers) were obtained from WorldClim, from the samples of The IUCN Red List of Threatened Species and the Global Biodiversity Information Facility (GBIF). The spatial resolution of all environmental variables was 30 seconds of arc, using the Maxent program. The nucleotide data of the mitochondrial cytochrome oxidase I (COI) and cytochrome b (cytb) genomes of the organisms under study with their respective sequence were extracted in FASTA format from the National Center for Biotechnology Information (NCBI) website. ). The nucleotide sequences were aligned through the digitalprogram Mesquite version 3.2 and the parsimony and maximum similarity test were applied, after which the Bootstrap and the Jacknife were applied to the Mesquite data. The most outstanding results were that it will increase the niche probability of the species, and the most closely related species according to the IOC are I. boliviensis and I.araguaeinensis and, according to the cytb, they are I.boliviensis and I. geoffrensi.